种田农民

感谢大家的真知灼见,我知道还有很多人有想法没有表达.

这里我的一些粗浅想法向大家学习请教:

 

1.构建IL的目的

 

1)QTL定位和克隆(大家都看到的,具体就不谈了,汗牛充栋的文章)

2)复杂数量性状的分析,比如

A.分析QTL和非QTL之间的互作;

这是一个比较有机遇和挑战的研究课题,QTL互作在复杂背景下不容易分析,但如果把大部分背景的噪音消除,或许可以拨云见日,有相当多的报道.非QTL的互做,简单说如果单位点没有显著效应,但两或者多位点水平有互作效应,如何研究?
先分子标记辅助选择构建这2个位点的IL,然后杂交看是否有效应,简单的构想,但可能是伟大的发现,也是张启发老师的梦想.尽管我持谨慎乐观的态度.

B基因组水平上阐释杂种优势的遗传基础.

如果全基因组水平的IL系群体都有了,可以简单的QTL分析,杂种优势遗传学基础,如上篇推荐的Zamir(此人是IL的鼻祖,应该跟踪)2006PNAS的文章.

3)其他目的,欢迎添加.

 

2)如何构建,有人已经谈到了.

 

我要强调的是,如果我们的目的仅是找一些主效QTL,然后详细分析之,简单说是为了发展材料,我更倾向于早代连续回交,然后标记选择.
然后撒网捞鱼,相信很多小鱼或者大鱼溜掉,或者抓的不是鱼而是泥巴,没有关系,你总会找到几条你想要的鱼.这个指导思想下,非常精确的比较分析,反复的争论是不现实的.如何提高找到大鱼的概率,2点值得考虑,1)观察田间表型基础上的自我判断;2)前人抓鱼留下的痕迹(如QTL定位的结果,如果一个人的结果有问题,但如果多个人都到此一游,你就不要强烈怀疑了).

这也是我目前的指导思想.

 

如果目的是为了复杂的数量性状分析,如上面提到的2,则需要严格的标记选择,而且早代就要选择.例子见余四斌老师作物学报的文章.这个有用,而且很有用,但一个研究生要完成这样的工作太难,工作量太大.
而且我个人认为,在一个分离群体里,特定性状的主效QTL只有那么7-8个或者10来个,或者更少,如此费劲周折,最终的效果不一定俱佳.同样的投入下,应该有更好的选择.如何选择,可以思考,讨论.

 

一次把所以的可能都做下来当然最好，但关键是可行性有多大，一个人在比较合理的时间内到底能做多少工作，个人不大希望大家把所有时间都投进去，而且结果可能不太好。如果授粉期间偶尔也能聊聊天，喝喝茶，然后活儿也漂亮，不是起早摸黑的打仗，我想生活也应该是一件惬意的事情！