Archive for 05月, 2007
准备系统的每周推荐文章!:)
星期三, 05月 30th, 2007这个我已经应该讲过,简单的说就是,在NCBI注册一个用户名,然后输入自己感兴趣的关键词,这样这个领域有最新的文章出来就会直接把文章的相关信息发送到你注册的邮箱,非常方便,你可以选择每周,每天或者每月更新.我目前是每天更新.
每周推荐(1)
星期三, 05月 30th, 2007Colloquium Papers: Plant domestication, a unique
opportunity to identify the genetic basis of
adaptation
PNAS 2007 104: 8641-8648; published online before print as
10.1073/pnas.0700643104
这是一篇讨论加观点的文章,
我主要感兴趣的是,对基因(作者这里主要谈到进化这类特定基因,但可以延伸)功能鉴定(非转基因)的方法的系统阐述,非常清楚.
1)
QTL定位结合关联分析,这部分写的非常的有创意,非常通俗易懂.
2)如果从分子群体遗传学(简单说就是分子进化)的角度来确定基因(主要是与进化有关基因)的功能.
分别有一篇文章详细谈了第二种思路(在前面推荐的140篇文章里有).
Ed的研究更倾向于第一种思路(他去年的综述文章谈到3种方法来鉴定基因,也是高屋建瓴).
感受Cornell大学的毕业典礼
星期一, 05月 28th, 2007
这个周末是Cornell大学的毕业典礼,或许,在美国人的生活中,毕业典礼和结婚典礼是一样隆重而重要的。几乎所有学生的重要亲属和朋友都会来参加。昨天是特别为博士生的一个毕业典礼,在室内大礼堂举行。内容简单但不失庄重,校长的简单致辞和老师代表的心声分享,然后齐唱校歌。最重要的一个仪式就是,一一念到毕业生的名字,然后上台分别与研究生院长和校长握手。没有中国的挑穗子仪式,但几乎所有毕业生的导师都身穿礼服和学生一起出席。场面非常热烈。让我感悟深刻的是,蜚声中外的Cornell竟然只有500多名博士,而赫赫有名的遗传育种系,我也只听到2个毕业生的名字(可能有遗漏)。据说整个遗传育种系一年的研究生招生数量不超过10个,教授估计比学生的数字还多。今年是Cornell遗传育种系的建系100周年,一系列的学术活动也纷纷展开,每两周都有一个学界大牛来做学术报告,而从事玉米研究(cornell的玉米非常强,大概有10个group)我所仰慕的大牛,如美国玉米界的泰斗,ED.Coe,
进化界的新星Jeff
等等都来过了。不可想象的是,整个遗传育种系竟然只有这么少的研究生。让我不竟想起了郭靖和全真七子的笑话。
今天是本科生的毕业典礼,据说毕业生首先是在校园里游行,亲属朋友会夹道欢迎(遗憾错过了),然后来到主体育场。Cornell的主体育场非常大,看台可以轻松容纳3万人,所有亲属朋友都在看台就座,我去的比较晚,放眼望去,基本没有发现空位,cornell总共只有大约5000毕业生,那就意味着,每个毕业生有一个6人左右的亲友团队来助威。所有毕业生和老师估计还有一些特别的嘉宾坐在体育场中间,场面非常壮观。据说每年都会请一个知名人士来给毕业生做励志演讲,遗憾错过。但在快结束时,毕业生手挽手高唱校歌的场面非常感人。比我所经历的毕业典礼要庄重和受重视的多。
是的,学生是一个大学最重要的产品,当毕业典礼结束就意味着这个产品正式生产完毕,而要接受市场的检验。Cornell
的本科教育非常严格,学生们在经受严酷考验的同时也充满自信,以为cornell的学生为荣。而学校在把毕业生送出校门的时候就为他们培养了一批合格的并且是优秀的产品而骄傲,并会持续为他们的产品在社会上发挥更大的作用而更骄傲。毕业典礼这个重要的仪式,不仅仅是告诉学生,从今天开始你就毕业了,而更重要的告诉家长和社会,你们花了巨资(Cornell的本科学费非常昂贵,一般的美国家庭也常常觉得难以接受)是值得的。我也相信,这样难忘的时刻,在每个走进或者走出Cornell的人都会留下深刻的印象,回想起来会觉得分外的珍惜。
站在Cornell的大体育场,感受这场狂欢的时候,我才深深体会到我们的大学教育还多么的任重而道远.也似乎让我理解了,前段时间网上热炒的清华大学博士退学的王垠(大家可以GOOGLE他的万言退学申请,看看他理解的大学和研究生教育).这个世界奇妙或者微小的是,我昨天竟然发现,王垠竟然也在CORNELL,而且与我住在同一个社区,物理距离不过100米.我相信,他应该会在这里找到他想要的科学研究!
壮观的会场,我站在主看台,背后是更多的黑压压的人群.
毕业生搭成人墙共唱校歌!
博士毕业生进场的场面
再来一张
红底白字的是cornell的荣誉列表,美国国旗下是另外几所牛校,难道CORNELL人认为,只有这些学校是才可以与她比肩的?
最牛的毕业生,他的博士帽是用鲜艳的五星红旗做成的!
人类基因组中有多少个基因?
星期一, 05月 28th, 2007Medicine in Houston, Texas, anyone who disagrees with this number
“will have to prove her wrong.”
服务同学是后勤工作的宗旨
星期六, 05月 26th, 2007顾左右而言他!
“韩大嘴”满嘴跑火车本性不改
星期三, 05月 23rd, 2007如果是那大嘴的称号果真不假,如果不是收回!
相信柴静会在这场嘴仗中获益
星期二, 05月 22nd, 2007
CCTV美女柴静因为在牛博的BLOG,而让我更加清晰的认识,其清新、犀利和深具社会良心的文字常为我所欣赏和学习。最近她的一篇博文“每一项技术的背后都是生命”却让我发现了她的弱点,一个文科出生的记者用煽情和唯美的文字来记录严肃的科学问题的时候往往会破绽百出,或者说不具备太多科学素养而感性的记者很容易被一个貌似大腕的科学家忽悠,本想感叹几句。以严谨出名的方舟子出手甚快,而且专业之至。争锋相对的是“并非每一项技术的背后都是生命”。牛人云集的牛博网,热闹起来,牛人纷纷出手。如姬十三“每一项技术的背后都可以找到生命”,莫之许“每一项技术背后都是人头”,土摩托”即使每一项技术的背后都是生命“等等。但比较遗憾的是,牛博网会码字的多,或高屋建瓴或诙谐幽默谈社会问题的多,真正如方舟子受过严格科学训练,又会码字的却寥寥。每一个看似华丽而振振有辞的反驳却都经不起推敲。方舟子毫不手软并不失幽默把姬十三拎出来痛打了一阵““胡扯流”之“反思””。嘴仗好象要结束了。可爱的柴静妹妹认真的出来回应方舟子,相信是非常诚恳的谈了四点。可惜关于干细胞这样相当专业的问题,既然承认自己不是做科学报道的记者其实一开始就不应该发感慨,发感慨也没有关系,却不应该写出来。哎,其实做名人也挺难的,因为挑刺的眼光总比含情默默关注的眼光犀利!四点回应,中间的2点相当的不专业,我相信柴静妹妹确实应该是不懂。不懂没有关系,努力学习就好,关于此问题的通俗教材应该属于方舟子去年的2篇文章。不懂又不学习,而大发“但是我想,把科学问题唯技术化,而忽视对伦理学的边界,生物安全的边界的思考,忽视科学研究的终极目的,带来的危险要更大。”这样的议论,和“
科学研究的重要前提是自知无知……”这样的结论,其确实比较显得自己缺乏科学素养。方舟子马上对回应进行了回应”反对胡扯不等于反对反思——回应柴静
“,我认为该回应并没有用方舟子常用的讽刺而更多的是科学知识的普及和事实的澄清。
新语丝也热闹起来,批评的文章一堆,角度各异,但科普的主题一致!相信有助于普通大众对这个问题的认识。我想如果柴静文章的主角也能出来澄清一下,故事将相当的完美。
柴静妹妹担心的边界问题成为问题的前提是它确实是一个问题。给一个通俗的比喻,长江水位上涨和胚胎的发育都是一个连续的过程,其实非常难绝对的确定哪个水位或者时间点是会出现质的变化的临界点。但我想没有人会认为有必要讨论长江水位在警戒水位以下好几米的时候大堤(比如枯水季节)是否安全这样的问题(即使危险性同样存在)。同样胚胎干细胞发育了14天和枯水季节的长江大堤一个样。所以再问14.1或者15天这样的问题绝对也是比较傻的。
不能怪柴静,相信在她偶尔的感慨而引发的争论中,给她的将更多是冷静的思考和犀利的目光!说这不定带有更多的科学元素!
祝福成河!
星期一, 05月 21st, 2007Journal的难度小的多:)