Archive for 05月, 2007


帅哥乐乐!

星期四, 05月 31st, 2007

 
 

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准备系统的每周推荐文章!:)

星期三, 05月 30th, 2007

  常常有同学给我发EMAIL询问如何读文章,或就某个领域的文章,请我推荐.其实文章浩如烟海,我所读的文章也非常有限.不过一点小经验可以分享:
  
   目前我读文章的主要手段是利用MY NCBI,
这个我已经应该讲过,简单的说就是,在NCBI注册一个用户名,然后输入自己感兴趣的关键词,这样这个领域有最新的文章出来就会直接把文章的相关信息发送到你注册的邮箱,非常方便,你可以选择每周,每天或者每月更新.我目前是每天更新.
  
    我目前主要关注这些领域的文章:
1)maize
2)rice
3)Rice QTL(其实2包括3)
4)comparative genomics
5)evolution
6)drought tolerance
7)heterosis
   大概每周有100-200篇新的文章进入我的视线,绝大多数(>95%)看了题目就放过去了,有3-4%大概会认真看一下摘要或者感兴趣部分;1-2%大约会认真读一遍,或者打印出来,有空的时候还会温习一下.所以准备每周从这1-2%里选出一篇推荐给大家.
 
一般来说,文章最好要分门别类的管理,(目前我的系统不算太好),分成不同的文件夹,并根据个人特点和习惯做一些标注,从研究生阶段开始到现在计算机里大约储存有3000-4000篇文献,但有印象的不过500篇.
 
这个方法比较的节约时间,大家可以尝试一下,除非写文章,否则不建议系统的拿出时间专门读文献.读文献这个东西要循序渐进,主要在平时积累.在形成自己的系统后,再读该领域的文献会比较的快并容易产生火花.

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每周推荐(1)

星期三, 05月 30th, 2007

 Jeffrey Ross-Ibarra,Peter L. Morrell, and Brandon S. Gaut
Colloquium Papers: Plant domestication, a unique
opportunity to identify the genetic basis of
adaptation

PNAS 2007 104: 8641-8648; published online before print as
10.1073/pnas.0700643104

这是一篇讨论加观点的文章,
我主要感兴趣的是,对基因(作者这里主要谈到进化这类特定基因,但可以延伸)功能鉴定(非转基因)的方法的系统阐述,非常清楚.

1)
QTL定位结合关联分析,这部分写的非常的有创意,非常通俗易懂.

2)如果从分子群体遗传学(简单说就是分子进化)的角度来确定基因(主要是与进化有关基因)的功能.

1)基于性状的正向遗传学手段;2)不基于性状的反向手段(更需要智慧)
 
Gaut BS 是分子进化方面的牛人,他去年plant cell 和science
分别有一篇文章详细谈了第二种思路(在前面推荐的140篇文章里有).
Ed的研究更倾向于第一种思路(他去年的综述文章谈到3种方法来鉴定基因,也是高屋建瓴).

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感受Cornell大学的毕业典礼

星期一, 05月 28th, 2007

 

    这个周末是Cornell大学的毕业典礼,或许,在美国人的生活中,毕业典礼和结婚典礼是一样隆重而重要的。几乎所有学生的重要亲属和朋友都会来参加。昨天是特别为博士生的一个毕业典礼,在室内大礼堂举行。内容简单但不失庄重,校长的简单致辞和老师代表的心声分享,然后齐唱校歌。最重要的一个仪式就是,一一念到毕业生的名字,然后上台分别与研究生院长和校长握手。没有中国的挑穗子仪式,但几乎所有毕业生的导师都身穿礼服和学生一起出席。场面非常热烈。让我感悟深刻的是,蜚声中外的Cornell竟然只有500多名博士,而赫赫有名的遗传育种系,我也只听到2个毕业生的名字(可能有遗漏)。据说整个遗传育种系一年的研究生招生数量不超过10个,教授估计比学生的数字还多。今年是Cornell遗传育种系的建系100周年,一系列的学术活动也纷纷展开,每两周都有一个学界大牛来做学术报告,而从事玉米研究(cornell的玉米非常强,大概有10个group)我所仰慕的大牛,如美国玉米界的泰斗,ED.Coe,
进化界的新星Jeff
等等都来过了。不可想象的是,整个遗传育种系竟然只有这么少的研究生。让我不竟想起了郭靖和全真七子的笑话。

     今天是本科生的毕业典礼,据说毕业生首先是在校园里游行,亲属朋友会夹道欢迎(遗憾错过了),然后来到主体育场。Cornell的主体育场非常大,看台可以轻松容纳3万人,所有亲属朋友都在看台就座,我去的比较晚,放眼望去,基本没有发现空位,cornell总共只有大约5000毕业生,那就意味着,每个毕业生有一个6人左右的亲友团队来助威。所有毕业生和老师估计还有一些特别的嘉宾坐在体育场中间,场面非常壮观。据说每年都会请一个知名人士来给毕业生做励志演讲,遗憾错过。但在快结束时,毕业生手挽手高唱校歌的场面非常感人。比我所经历的毕业典礼要庄重和受重视的多。

   是的,学生是一个大学最重要的产品,当毕业典礼结束就意味着这个产品正式生产完毕,而要接受市场的检验。Cornell
的本科教育非常严格,学生们在经受严酷考验的同时也充满自信,以为cornell的学生为荣。而学校在把毕业生送出校门的时候就为他们培养了一批合格的并且是优秀的产品而骄傲,并会持续为他们的产品在社会上发挥更大的作用而更骄傲。毕业典礼这个重要的仪式,不仅仅是告诉学生,从今天开始你就毕业了,而更重要的告诉家长和社会,你们花了巨资(Cornell的本科学费非常昂贵,一般的美国家庭也常常觉得难以接受)是值得的。我也相信,这样难忘的时刻,在每个走进或者走出Cornell的人都会留下深刻的印象,回想起来会觉得分外的珍惜。

    站在Cornell的大体育场,感受这场狂欢的时候,我才深深体会到我们的大学教育还多么的任重而道远.也似乎让我理解了,前段时间网上热炒的清华大学博士退学的王垠(大家可以GOOGLE他的万言退学申请,看看他理解的大学和研究生教育).这个世界奇妙或者微小的是,我昨天竟然发现,王垠竟然也在CORNELL,而且与我住在同一个社区,物理距离不过100米.我相信,他应该会在这里找到他想要的科学研究!

壮观的会场,我站在主看台,背后是更多的黑压压的人群.

毕业生搭成人墙共唱校歌!

博士毕业生进场的场面

再来一张

红底白字的是cornell的荣誉列表,美国国旗下是另外几所牛校,难道CORNELL人认为,只有这些学校是才可以与她比肩的?

最牛的毕业生,他的博士帽是用鲜艳的五星红旗做成的!


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人类基因组中有多少个基因?

星期一, 05月 28th, 2007

 准确答案是:20488.
来自本期的SCIENCE杂志.
牛的是:
Now, says Stephen Richards, a genomicist at Baylor College of
Medicine in Houston, Texas, anyone who disagrees with this number
“will have to prove her wrong.”

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乐乐作品展(4.7岁)

星期日, 05月 27th, 2007

 我眼中的世界:
 
这个是男兔子
 
这个是穿高跟鞋的女兔子
 
我眼中的鱼
 
还是鱼!
 
 
 

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服务同学是后勤工作的宗旨

星期六, 05月 26th, 2007

 五色土BBS反映便利店停业带来不便 相关部门负责人解释原因并表示公开招标中同学有自主选择权
 
校长助理、后勤基建处处长张文立表示,学校领导及部门对同学们意见非常重视,调查了解到“大学生便利店”停业纯属合同正常终止,原店面将重新招租。
 
如果是正常,难道非要到停止营业才想到要重新招租?
 
便利店店面将重新招租,原来业主完全可以参加新一轮的招标。
 
和停业有关系还是此地无银?
 
张文立重申,“服务同学是后勤工作的宗旨”,在今后与各承租商户所签署的合同中,均明确一条:在学生管理组织监督过程中,凡发现是因服务质量引起的问题,通过一定程序可单方面中止合同,“服务质量问题一票否决”。
 
西校区“大学生便利店”位于动力楼一楼浴室门口(即现在的乐福店铺面),曾因物品齐全和良好的服务态度受到西区不少同学的欢迎。
 
同学反映的是停业带来的不便,不是服务质量问题!
顾左右而言他!
 
口号喊的越响的人,内心其实更阴暗!比如:我要救中国,我要改变这个制度;但却救不了自己的家庭,救不了自己的儿子,比如贪官.今天刚听来的.
 
 

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“韩大嘴”满嘴跑火车本性不改

星期三, 05月 23rd, 2007

 ”在美国,文化、体育的总产值占国民总产值的62.8%.”(http://news.cau.edu.cn/show.php?id=0000028454)
 
农大名家论坛请了韩乔生老师来讲,呵呵也迎合了奥运主题.这句话果真是他说的吗?
如果是那大嘴的称号果真不假,如果不是收回!
 
稍微动动脑子想想这个数字显然不可能是对的,美国一年的GDP超过12万亿美圆,意味着有超过7万亿来自文化和体育,按韩老师说的NBA一年产值80亿元,那得有多少个NBA啊!
 
再不行,google啊,写文字的记者看来还太年轻!
 
“你在家乡找个塑料厂生产塑料棍,印上日本、韩国、德国的旗子,或者有名运动员的卡通像随便一印,奥运会的时候肯定一抢而空,这就是机会。”这个建议也相当的不靠谱,难道他不知道有肖像权一说?

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相信柴静会在这场嘴仗中获益

星期二, 05月 22nd, 2007

 

    CCTV美女柴静因为在牛博的BLOG,而让我更加清晰的认识,其清新、犀利和深具社会良心的文字常为我所欣赏和学习。最近她的一篇博文“每一项技术的背后都是生命”却让我发现了她的弱点,一个文科出生的记者用煽情和唯美的文字来记录严肃的科学问题的时候往往会破绽百出,或者说不具备太多科学素养而感性的记者很容易被一个貌似大腕的科学家忽悠,本想感叹几句。以严谨出名的方舟子出手甚快,而且专业之至。争锋相对的是“并非每一项技术的背后都是生命”。牛人云集的牛博网,热闹起来,牛人纷纷出手。如姬十三“每一项技术的背后都可以找到生命”,莫之许“每一项技术背后都是人头”,土摩托”即使每一项技术的背后都是生命“等等。但比较遗憾的是,牛博网会码字的多,或高屋建瓴或诙谐幽默谈社会问题的多,真正如方舟子受过严格科学训练,又会码字的却寥寥。每一个看似华丽而振振有辞的反驳却都经不起推敲。方舟子毫不手软并不失幽默把姬十三拎出来痛打了一阵““胡扯流”之“反思””。嘴仗好象要结束了。可爱的柴静妹妹认真的出来回应方舟子,相信是非常诚恳的谈了四点。可惜关于干细胞这样相当专业的问题,既然承认自己不是做科学报道的记者其实一开始就不应该发感慨,发感慨也没有关系,却不应该写出来。哎,其实做名人也挺难的,因为挑刺的眼光总比含情默默关注的眼光犀利!四点回应,中间的2点相当的不专业,我相信柴静妹妹确实应该是不懂。不懂没有关系,努力学习就好,关于此问题的通俗教材应该属于方舟子去年的2篇文章。不懂又不学习,而大发“但是我想,把科学问题唯技术化,而忽视对伦理学的边界,生物安全的边界的思考,忽视科学研究的终极目的,带来的危险要更大。”这样的议论,和“
科学研究的重要前提是自知无知……”这样的结论,其确实比较显得自己缺乏科学素养。方舟子马上对回应进行了回应”反对胡扯不等于反对反思——回应柴静
“,我认为该回应并没有用方舟子常用的讽刺而更多的是科学知识的普及和事实的澄清。

    

     新语丝也热闹起来,批评的文章一堆,角度各异,但科普的主题一致!相信有助于普通大众对这个问题的认识。我想如果柴静文章的主角也能出来澄清一下,故事将相当的完美。

   

     柴静妹妹担心的边界问题成为问题的前提是它确实是一个问题。给一个通俗的比喻,长江水位上涨和胚胎的发育都是一个连续的过程,其实非常难绝对的确定哪个水位或者时间点是会出现质的变化的临界点。但我想没有人会认为有必要讨论长江水位在警戒水位以下好几米的时候大堤(比如枯水季节)是否安全这样的问题(即使危险性同样存在)。同样胚胎干细胞发育了14天和枯水季节的长江大堤一个样。所以再问14.1或者15天这样的问题绝对也是比较傻的。

     不能怪柴静,相信在她偶尔的感慨而引发的争论中,给她的将更多是冷静的思考和犀利的目光!说这不定带有更多的科学元素!


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祝福成河!

星期一, 05月 21st, 2007

 喜悉:
 
    领我进分子生物学实验大门的张老师终成眷属了!不知道张老师的铁哥们,老汤(老汤儿子亦有贡献),继华师兄是否喜极而泣.我们的话题终于又少了一个,不过估计下一个是什么时候该抱个胖小子!当然姑娘也行!
 
   同门的帅哥海林同学也报得美人归了,记得出国前的武汉之行,他还是形影相吊,显然找美人的难度比发plant
Journal的难度小的多:)
 
   同班的美女纪芳同学,也幸福着幸福了!夫君是帅帅的班长昌明君,相信这对新人马上会双双拿到博士学位,说不定还顺便一并升级,所以期待四喜临门!
 
   同班的另位美女石玮同学也终成眷属,祝福也真心实意的送上.想起了大约十年前在我老家低矮的平房一起畅饮米酒而半夜找水喝的难忘岁月,当然这样的故事常常少不了久无音信的小曹同学和宗老师.
 
   想起宗老师,也送上祝福,呵呵,据说140的大房子已经在计划中了,呵呵,祝福宗夫人美女蔡老师.给我一个铺板的位置就好了!:)另,顺便做个赞助广告,有银子的同学好友可以适当考虑友情支持一点!呵呵,到时候睡客厅比较的理直气壮!
 
   祝福成河,这个春天原来是如此的惬意和阳光!
 
 
 

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