从第50届玉米大会看玉米基础研究的未来
| 03月 6th, 2008 | by zhongtiannongmin |
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关键词：应用，NAM(数量性状)，基因组测序，突变体
1. 从基础到应用
记得我在去年的总结中，提到农业部的官员问，如何填充基础研究和实际应用之间的鸿沟。今年尤其强调，所以开幕之后有一个特别的专题,
“TRANSLATING GENOMICS TO MAIZE
IMPROVEMENT”。并邀请了多家媒体到场，其深远意义在于告诉公众，我们的科学研究有什么用处。该专题，共有7个报告，总结一下包括3个方面的内容：
1）
分子育种，第一个报告来自先锋公司的育种，探讨基因组学尤其分子标记如何在分子育种大规模应用，高屋建瓴，其广度和深度不但中国就是美国的公立机构也无人能及。我们整天谈分子育种，甚至分子设计育种，估计其理念不及人家的皮毛；第4个报告来自Dow
Agrosiences的科学家谈生化和遗传研究对玉米遗传改良的影响和意义；第5个报告来自孟山都公司的科学家谈转基因技术在玉米抗旱研究中的应用。给大家一个简单的数据，孟山都已经对超个10000个基因进行玉米转基因研究，通过多轮选择，最后确定了大约10个有商业应用前景的基因，其中著名的一个就是去年发在PNAS的一个转录因子（我推荐过）。其规模望尘莫及！第7个报告，是本人关于玉米维生素A生物强化的一个报告，与之前高屋建瓴的报告不同，我的报告涉及的是一个具体的CASE研究；在关联和连锁分析的基础上，开发功能标记进行分子育种研究是将来必经的一个途径，尤其对于小单位和发展中国家（基本思路之前我谈过），应该说结果和反应都应该还不错。以上这些研究毫无疑问给今后玉米分子育种（MAS，转基因）提供了方向。玉米研究工作者值得体会。
第一次在超过500人的专业会议上作报告，照片不咋地:-）
2）
杂种优势基础研究对玉米基因组研究的潜在影响。有2个报告，分别是来自先锋公司的Guo
Mei和Minnesota大学的Springer。简单的总结是，杂种优势的研究已经从遗传学水平深入到功能基因组水平。具体的思路和进展就不展开阐述了。
3）
数量性状研究的新设计新思路。这个就是来自Cornell大学的Ed
Buckler的NAM设计对开花期的研究。这个设计，为我们复杂数量性状研究尤其QTL克隆提供了第三种选择。
与美国玉米届的KING Ed Coe在一起，报告也得到了他的称赞
2. NAM
1） NAM (Nested Association
Mapping，B73分别与25个典型自交系杂交创造的25个RIL群体)，这一研究数量研究的新设计无疑是改次会议的明星，三个人贡献巨大，分别是Cornell大学的Ed
Buckler, Missouri-Columbia大学的Michael McMullen, North
Carolina大学的James Holland.
ED首先从宏观上进行了阐述，其报告信息量太大，每个博士后的工作只能用一张幻灯片来讲述。后两人则分别从NAM群体的连锁图和表型进行了补充阐述。
2） 改设计把QTL克隆放在了RIL群体而不是常规的NIL，其Power和精度让我们静待他们的文章。7000RIL的1500SNP的标记分析大约数星期就完成了（数据已经公开，有兴趣的可以去看看），其效率和规模就大约可以让我们了解基因组发展的水平。我们也可以掂量一下我们小作坊的生产还可以维持多长时间。
3） NAM的风靡程度，还可以用一个数字来表示，大会大约有30个相关的poster，占1/8强，有3个大会报告。其真正的精彩研究文章估计近1-2年就会出现。
3. 玉米基因组测序
1） B73序列草图终于赶在玉米大会上公布，大会不仅有一个专门的专题讲玉米序列，同时还有专门的新闻发布会。为了给政府要员，新闻媒体提供一个了解玉米研究的动向，大会特别准备了一个专门的POSTER，要求受邀的科学家用通俗易懂的话语表达他们的研究内容。本人不才，但也是受邀的VIP之一，所以荣幸出席了新闻发布会。因为生物强化也是一个主题之一，考虑到以后文章发表问题，讨论过后，我决定在新闻发布会上闭嘴，而ED和Torbert却西装革履，意气风发。
Tobert
在新闻发布会后向Harvestplus项目主任Howarth Bouis博士介绍我们的工作
2） 当然新闻发布会的主要议题在基因组测序，公开提问阶段，所有问题都是测序。令人想不到的是，墨西哥的一个国家研究机构也用454完成了当地一个玉米品种的测序，所以也受邀在新闻发布会上。并在大会上做了30分钟的特别报告。
玉米测序团队！左一为墨西哥团队代表，发言的是曾主持人类基因组测序的Rick
Wilson，他是玉米测序的总负责人！
3） 玉米基因组测序对玉米基因组研究的影响是巨大的，最简单的是让QTL和基因克隆变得更容易。我可以预言，在今后几年内，相关文章会如雨后春笋。如水稻一样。如何用这些序列，值得深入思考。比如，大会上先锋公司的就报告了一个高油QTL的克隆（我之前也推荐过文章）。
4. 突变体
突变体毫无疑问仍然是这次大会的主角之一，利用突变体深入开展，基因的克隆，详细的生化途径，相关的生物学现象的分子机理研究（如副突变，表观遗传等）仍然是热门的研究，尽管我个人并不喜欢，但不得不承认，我们主要的生物学基础知识都得益于这些细致而深入的工作。就不详细展开，有兴趣的可以去看看摘要或相关的报告（大部分PPT将会在MAIZEGDB上挂出来）。